По умолчанию аудитория созданная только через сегмент аудиторий в Метрике и сегмент аудитории в Директе - эта аудитория достаточно ограничена. И объем этой аудитории может составить только тысячи или десятки тысяч единиц - а хочется побольше:

Тут на помощь приходят Яндекс Аудитории - в них аудиторию для минусации можно расширить от 500 тысяч до 4 миллионов посетителей.
1. Создаем сегмент аудитории ботов в Яндекс Метрике.
Создаем сегмент ботов в Яндекс Метрике. Для этого заходим в метрику и выбираем отчет: посещаемость:
Далее через фильтры выберем только заходы ботов. Для этого в фильтре "Для людей у которых" выбираем "Параметры посетителя" => "fraud.true" (или какой другой параметр, который нужен):
Далее нажимаем "Применить" - у нас отобразились только визиты, которые помечены как боты. По желанию вы можете дополнить этот сегмент своими условиями, например - выбрать только визиты Директа, которые помечены как боты - это уже на своё усмотрение.
Далее сохраним все эти визиты в сегмент аудитории ботов:
Вводим название сегмента. В названии сегмента рекомендую указать url сайта и условие по которому создан сегмент - чтобы потом не ошибиться:
Все - нажимаем сохранить.
Сегмент аудитории создан.
Далее нам нужно перейди в Яндекс Аудитории и там на основании этого сегмента мы создадим аудиторию и похожую аудиторию общим объёмом более 500000 пользователей (ботов).
2. Создаем сегмент аудитории ботов в Яндекс Аудиториях
Переходим в Яндекс Аудитории и нажимаем "создать сегмент" на основе Яндекс Метрики:
Далее создаем сегмент аудитории на основе нашего сегмента в Яндекс Метрике:
Нажимаем "создать сегмент". После этого нужно подождать часа 3, пока сегмент будет создан:
3. Расширяем сегмент аудитории ботов на 500000 посетителей
Нажимаем на кнопку "создать сегмент" и выбираем "похожий сегмент":
Далее введите название сегмента - в названии рекомендую указать сайт и объем аудитории для минусации, чтобы потом не запутаться.
За объем создаваемой похожей аудитории отвечает ползунок - его крайнее левое положение - это 500000 , а крайнее правое - 4 000 000.
Далее нажмите "Создать сегмент" и нужно будет подождать еще несколько часов пока сегмент будет создан.
4. Делаем корректировку ставок в кампании Яндекс Директ на этот сегмент до -100%
Переходим в настройки кампании Яндекс Директ, находим "корректировка ставок", и там выбираем созданный нами сегмент: